风冷微波设备和水冷微波设备是指微波设备的电器部分采用的是风冷或是水冷，对整个设备来说，唯一不同的是电器的冷却方式。其它电性能不变。
微波设备电器部分由微波磁控管、微波变压器、微波硅堆、微波电容和低压电器组成。微波设备中主要发热的是磁控管及变压器两个部件，在工作时，由于变压器要实现电压的升压转换，磁控管负责把电能转化为微波能。这两个器件的工作温度均有超过100度的可能。为了保证这种两器件的使用寿命，必有效控制这两种器件的最高工作温度，所以在设计时要充分考虑设备的散热问题。
一般来说，如果微波设备每天的工作时间需要超过16个小时，由于工作时间较长，建议采用水源对磁控管和变压器进行冷却。如果每天工作时间较短则可能考虑用风冷散热。
采用风冷时一般只需采用轴流风机即可，如果要采用水冷方式，即还需要建水池和冷却塔，冷却前的进水温度要控制在32度以下，器件的使用寿命可大大加强，可连续20小时以上工作不停机生产。水冷设备一般适用于当作微波干燥设备用来干燥的产品要求较低（达到1%以下），且是粉状物料或化工原料，综合考虑粉尘对电器的保护，建议采用水冷+油冷散热方式的微波设备。
风冷散热是早期工业微波的主要散热方式，优点是维修简便，无需辅助配套。缺点是不宜长时间连续使用，尤其在粉尘多、潮湿、有腐蚀性气体的环境中稳定性很差。风冷的变压器工作耐温可达到180度左右，如果环境通风良好，环境温度在40度以下，风冷变压器可以长期使用，但我们不建议风冷设备超过12小时连续不停机生产，建议用户使用8-10时候停机30分钟冷却后再开启。
